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成立緣起/（運籌帷幄 決勝千裏）
2003 年 SARS 在全球肆虐，亦曾嚴酷地考驗著我政府機關在防疫動員時的危機處理能力。因此，我國需要一座以疫災為主的防災中心，作為中央與區域、地方直接聯繫的作戰指揮據點；並藉由完善的軟硬體功能與暢通的聯絡通訊系統，建構完整的資訊平臺，以提供決策者完整的災情及資源訊息。期望在這套中央統一指揮系統之下，能夠有效地進行流行疫病、生物病原災害、反生恐及緊急醫療等災難應變。
有鑑於此，政府決定以疾病管制署七樓為基地，建置國家衛生指揮中心(National Health Command Center, NHCC) ，結合中央流行疫情指揮中心、生物病原災害中央災害應變中心、反生物恐怖攻擊指揮中心及中央緊急醫療災難應變中心等功能，共同架構完整的防災啟動機制。
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